Jeune couple amoureux, C (Casey Affleck) et M (Rooney Mara), emménagent dans une maison modeste en dehors de la ville. Quand C meurt dans un accident de voiture, M est d’abord inconsolable. C, lui, reste présent auprès d’elle, visible seulement pour nous spectateurs...
A 9 ans, le timide Yura quitte Tokyo avec ses parents pour aller vivre chez sa grand-mère à la campagne. Il doit dès lors fréquenter une école chrétienne où il découvre des pratiques religieuses qui lui sont complètement nouvelles...
Gepetto, vieux menuisier solitaire et fauché, sculpte un petit bonhomme de bois qu’il nomme Pinocchio. Quand celui-ci bouge, rit, parle et pleure comme un enfant, Gepetto décide de l’aimer comme son fils...